По фото сложно понять, патология ли это. Возможно и какое-то врожденное недоразвитие глазных яблок, или они просто маленькие, или последствия перенесенного заболевания. Если крысу ничего не беспокоит, хороший аппетит, активность в норме и глазки чистые, я бы пока не беспокоилась. Следите за поведением, нет ли каких особенностей, нормально ли видит. У меня есть крысы с не очень большими глазами, они отличаются от обычных, как бы немного выпученных, глазок, на здоровье это не сказывается.