По фото, мне кажется, больше всего похоже на травму. Но, как вариант, может быть и вскрывшийся абсцесс. Крыс в клетке один живет? Погрызть его другие крысы не могли?
В любом случае промывала бы ранку антисептиками (хлоргексидин, мирамистин и т.п.) и закладывала бы в ранку мазь с антибиотиком (левомеколь, например). Если это абсцесс, попробовала бы прощупать, не осталось ли внутри содержимого.