Я так понимаю, что в зависимости от того, какая его природа...
Вот, например: "...В тех случаях, когда мегаколон обусловлен пороками развития кишечника, — лечение оперативное. В других случаях благоприятный эффект может быть достигнут с помощью консервативного лечения, включающего назначение соответствующей диеты, витаминов, гормональных препаратов и др." (с) Это, правда, про людей написано...